当您的域名下有许多二级域名，并希望为它们全部或部分使用SSL证书以确保安全的HTTPS连接时，有几种方法可以考虑：

1. 使用通配符SSL证书

通配符SSL证书是一种特殊类型的证书，可以用来加密主域名下的所有二级域名。例如，如果您拥有域名`example.com`，一个通配符SSL证书（`*.example.com`）将覆盖`mail.example.com`、`shop.example.com`等所有二级域名。这种方法简化了管理过程，因为您只需购买和维护一个证书即可覆盖所有子域。

2. 使用多域名SSL证书（SAN证书）

多域名SSL证书（Subject Alternative Name, SAN证书）允许您在单个证书中列出多个具体的域名（包括二级域名和不同的主域名）。这种证书适合那些需要为数量有限的多个不同域名提供保护的情况。

 3. 为每个二级域名单独购买SSL证书

如果您的需求更加复杂，或者您出于管理上的考虑希望为每个二级域名单独控制其SSL证书，您可以为每个二级域名单独购买和配置SSL证书。这种方法管理起来最为复杂，但它提供了最大的灵活性。

 选择最佳方案

选择哪种方法取决于您的具体需求、预算以及管理复杂性的容忍度：

- 通配符SSL证书：适用于主域名下有大量二级域名的情况，需要简化证书管理工作。

- 多域名SSL证书（SAN证书）：适用于需要在单个证书中保护几个特定域名的场景。

- 为每个二级域名单独购买SSL证书：适用于需要对每个二级域名进行单独控制的复杂场景。

最终，确保您的所有网站和应用都通过HTTPS服务是非常重要的，这不仅保护了传输中的数据安全，还有助于提升用户信任度和改善搜索引擎排名。